Pri všetkých tých hrozivých paralelách s vraždou Anny Politkovskej, ktorú zastrelili na jar 2006 v domovom vchode, vykazuje prípad Natálie Estemirovovej aj jeden výrazný rozdiel.
V roku 2006 prezident Vladimir Putin ten „odporný skutok" síce odsúdil, ale mal dojem, že svoje vyhlásenie ešte musí o pár riadkov doplniť. Povedal, že obeť bola vo svojej kritike ruských a čečenských úradov „až príliš radikálna", ale vehementne poprel, že by objednávateľom vraždy mohol byť muž z Moskvy v Čečensku. Zato ukazoval prstom na páchateľov v istých kruhoch, „ktorí utiekli pred ruskou justíciou do cudziny" a majú záujem na tom, aby sa „na Západe šírili protiruské nálady".