V závere volebného obdobia si vicepremiér Ivan Mikloš sadá do horúceho kresla ministra dopravy. Doteraz neniesol zodpovednosť za riadenie rezortu, koordinoval len niektoré vládne projekty. Jeho výkonná agenda bude teraz oveľa hmatateľnejšia. Bude riadiť ministerstvo dopravy už len pár mesiacov, a preto nie je vylúčené, že nechce pri výkone tejto funkcie vystupovať aktívne a obmedzí sa len na administrovanie. Napriek tomu sa však musí podpredseda vlády vyrovnať s konfliktom medzi ministerstvom dopravy a železnicou, ktorý ostal nevyriešený po medializácii kauzy ľahké motorové vlaky.
Oficiálny stav je dodnes taký, že ministerstvo dopravy nesúhlasí s výsledkami hlasovania výberovej komisie na dodávku ľahkých motorových vlakov pre železnice. Generálny riaditeľ železníc Andrej Egyed a predseda výberovej komisie Miroslav Dzurinda zasa trvajú na tom, že rozhodnutie v prospech konzorcia ŽOS Vrútky - Stadler bolo správne. Možno predpokladať, že s príchodom Ivana Mikloša na ministerstvo sa stanovisko tohto ústredného orgánu štátnej správy k tendru zmení. Mikloš už totiž prinajmenšom cez médiá prezentoval názory, ktoré boli identické s doterajšími vyhláseniami premiéra Mikuláša Dzurindu. Všetko teda nasvedčuje tomu, že železnice aj vedenie ministerstva budú mať zhodný názor na výsledky tendra. Ak by však Mikloš napokon dospel k názoru, že nákup vlakov od konzorcia by bol nevýhodný a tender treba zrušiť, musel by postupovať inak ako jeho predchodca. Rozhodnutie o nákupe vlakov je totiž v plnej kompetencii železníc. Minister im v tom môže zabrániť len tak, že odvolá generálneho riaditeľa Železničnej spoločnosti, ak nadobudne presvedčenie, že koná proti záujmom štátu.